水利水电工程二建考《建设工程施工管理》、《建设工程法规及相关知识》以及《水利水电专业工程管理与实务》三个科目。在连续的两个考试年度内通过三个科目考试的，可取得二级建造师水利水电工程专业证书。
水利水电工程二建的考试题型有单选题、多选题和案例题三种，其中《建设工程施工管理》与《建设工程法规及相关知识》两个科目只考单选题和多选题两种题型；《专业工程管理与实务》考单选、多选和案例题三种题型。
水利水电工程二建的考试题型及分值分布如下：
《建设工程施工管理》科目包含单项选择题70道，每题1分；多项选择题25道，每题2分。
《建设工程法规及相关知识》科目包含单项选择题60道，每题1分；多项选择题20道，每题2分。
《水利水电专业工程管理与实务》科目包含单项选择题20道，每题1分；多项选择题10道，每题2分；案例分析题4大道，每题20分。