摩托车电池不存电的具体原因：
1、整流器不配套。
2、电机发电线圈损坏。
3、整流器与电瓶或者保险丝，连接线接触不良。
4、电瓶损坏自放。
5、全车线路有故障或者关闭电锁后自放。
6、整流器充电电流过。
7、摩托车上(白天晚上充电转换开关)泄流电阻损坏(现在车很少有这样的开关了，主要设计的是为了白天负载小时充电电流小，晚上开大灯用电负载大时充电电流大，起着保护电瓶的作用，有极个别的车还有，现在一般没有的多）。
8、照明线路更改设计不合理(例如以前大灯用电机电照明，现在改为共用电瓶电照明，更改线路要取决于电池容量及灯泡和充电电流是否搭配合理，很多没有电子基础的维修工不考虑否搭配合理就给用户乱改的导致用户及早报废电瓶的也很多）。
9、安装的大灯增亮器不合。