个人所得税申诉可能会对其造成以下影响：
1、财务成本增加，如果公司的员工提出个人所得税申诉并获得了退税，公司需要承担相应的财务成本，包括退税金额和相关手续费用等。
2、税务风险增加，如果公司的员工提出个人所得税申诉并获得了退税，税务机关可能会对公司进行税务检查，以确定公司是否存在违规行为。如果发现公司存在违规行为，将会面临罚款和其他法律责任。
3、影响员工士气，如果公司的员工对个人所得税征收存在异议，可能会影响员工的士气和工作积极性，从而影响公司的业务运营。
因此，公司应该积极关注员工的个人所得税申诉情况，并及时与税务机关进行沟通和协商，以减少可能的财务成本和税务风险。同时，公司应该加强员工的税务培训和宣传，提高员工的税务意识和合规意识，避免因员工个人所得税问题对公司造成不必要的影响。