因为四科涉及的内容不同，所以要定义哪科最难，就要因人而异、因行业而已。因人而已就是你哪科学的不好，哪科就最难，这个就不多说了。因行业而已就是你从事行业哪科涉及的少，哪科就最难。医药行业大致细分为药品生产（药厂、研发等）、药品经营（批发、药店等）、使用（医院、诊所等）三个行业，难易程度可以划分如下：
1、药事管理与法规三个行业均有涉及内容，三个行业的难易程度基本一样。
2、中药学综合知识与技能生产的涉及较少，这科对生产来说是最难的，其他行业涉及较多相对就简单一点。
3、中药专业知识一经营、使用的涉及较少，这科对经营、使用来说最难。但这是生产的强项，生产的基本都能轻松拿下。
4、中药专业知识二药品生产、药品批发涉及较少，但是其他行业也只是涉及有限的一部分内容优势也不明显。中药专业知识二主要是需要记背的内容，只要能多花些时间、精力去记忆，就没有太大难度，顺利过关不是问题。